西元1999年，一顆不(🚁)明的巨大「流星」墜落在地(🥎)球上。之後調查證實這其實是一艘(🎟)外星人的宇宙船，之(🏠)後世界的某些強國為了將其修復並彌補墜落時對地球環(🔵)境所造成的破壞（還得掩蓋掉這個外星船墜落的事實），而組成了統合政府。並由地球統合軍將其改造(🥥)成為全長1200公尺的超(🕵)大型主力戰艦，命名為「(✏)馬克羅斯」（MACROSS，德文「大宇宙」之意）。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂，在綿延的爭戰中馬克羅斯的改修則仍然持續著。直到10年後，在馬克羅斯舉行正(🍀)式起用下水典禮的當天，在月球軌道附近突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅(👏)斯艦上的主炮竟自動發射(🔘)，並擊中在月球出現的外星艦隊觀測艦！事已至如(🔪)此頓時成了趕鴨子上(🗣)架，不把對方惹毛才是怪事……於是統合軍只好展開接戰，並讓馬克(🛳)羅斯升空啟航，以轉移敵方注意。青(🛅)年一條輝陰錯陽差的坐上了統合軍的戰機捲入戰鬥，並救(🔶)起了一位名叫林明美的少女，且與艦上女軍官早賴(🐘)未沙的不吵不相識……被稱為「第一次宇宙大戰」的這場人類對異星人的戰爭就此揭開了序幕。而圍繞(🤔)在輝、明美與未沙之間的感情糾葛，卻也開始介入了戰事的發展之中(💵)，甚而(💙)成為主導後來歷史走向(👈)的(🦈)契機……