将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟(🐲)由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是(⚪)各自在喜(㊗)欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变(🛵)成了(🍢)四个独来(🐌)独往的“独行侠”！这时，纽约市中发生一连窜的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意(🙌)图征服(✡)纽约市，秘密培养了一支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！神龟们又处于备战状态了！他们(🥃)再次联合起来，准备向黑暗势力出击！