工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(☝)伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他(❕)的阿笠博(📐)士，博士为他度(⛄)身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团(🥈)伙对他(🃏)进行报复，新一决定隐姓(😓)埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友(🌭)毛利兰来到了(⛓)阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(🔄)柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(💌)私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一(🔨)起追查黑夜人(🏾)的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！