工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯(♓)罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(🛒)帮助他的阿笠博士，博(😥)士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋(🏕)名，暗(🐁)中追查他们，希(🌓)望(🗨)能得到解药。一日(🤬)，新一 的女友毛(💂)利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞(🖖)见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦(🏫)探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南(🏭)在小学认识步美等小(🛁)学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！