故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「(🗑)SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到(🛄)全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出(⛰)现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因(🥅)骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了(📀)出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的(⛽)战斗中，「Playmaker」使(🦊)用(🚲)压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手(🏵)的迷之AI程序。一度拯救了世界(🌊)，然后却(🤡)突然消声匿(🏽)迹了(😰)，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名(🅰)远播，成为了传说。而(🥑)现在，作为「Playmaker」的(🏍)正体的某位高中生藤木游作，为了寻找(🏌)过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了(🤹)追击...... 以此为契机，命(🏵)运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「(🔡)海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的(💀)，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有(🕶)的答案，都在「Link Vrains」中