故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术(📿)社」通过(💬)高度的网络技(👡)术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在(🏖)「LINK VRAINS」中(😖)却出现(✏)了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团(🐫)」(🙇)。而他们的目标是将存在于互联网的某(👅)处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站(🌋)了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的(📏)决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」(🐡)和(👴)「海诺因骑(🎁)士团」都(🎐)想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名(💌)远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中(😿)生藤木游作，为了寻找过去发(♿)生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「(🤑)海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此(⛎)转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答(📜)案，都在「Link Vrains」中