故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网(🐆)络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全(😒)新的决(📒)斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「(📪)海诺(😼)因骑士团(⛳)」。而(💼)他们的目标是(💞)将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界(🎩)”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性(😒)的决斗将「海诺因骑士团(😐)」打倒(🐗)，成功捕获了「SOL技术社」(🥕)和「海诺因骑士团」都(🍠)想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声(🥙)匿迹了(🥗)，而他的名字就在互联网的世界中一(🛵)瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游(🍊)作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海(⏩)诺因骑士团」盯上「(🚹)Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中