故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那(🌨)里有经由巨型(🚔)企业「SOL技术(🐣)社」(🏥)通过高度的网络技术构(🤯)筑而成的被称为「LINK VRAINS」的(📴)VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在(🍑)「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来(🥇)进行黑客行为的谜之(🥥)黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联(😀)网的某处的“AI们(🕖)的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术(🦋)社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序(💦)。一度拯救了世界(🎎)，然后却突然消声匿迹了，而他的(🎉)名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名(🕯)远播(😕)，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过(🤷)去发生的某件事件的真相，对再次(🌼)在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开(🎦)了追击(💗)...... 以此(🕺)为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中