故事的舞台是互联网系统发达的(🏫)都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而(⏱)成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那(🥕)个(📢)VR空间中为体验到(🕞)全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了(⏲)利用决斗来(📯)进行黑客行为的谜之黑客集团(🌉)「海诺因骑士团」。而他(🐥)们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界(🏀)受到这(🐎)样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他(⏹)的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹(🚗)了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变(🤺)得声名远播，成为了传说。而现在，作(⏹)为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现(🐿)的「海诺因骑(⚪)士团」展开了追击(👶)...... 以此为契机(😕)，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯(👏)上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真(🐙)相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中