故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企(🗃)业「SOL技(🚭)术社」通过高度的网络技术构筑而成(🆗)的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现(🐡)了利用决斗来进行黑客(👩)行为的谜之黑客集团「海(🚰)诺因骑(🥣)士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的(♓)名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」(🛣)使用压倒性的决斗将「海诺(😳)因骑士团」打倒，成功捕获了(✊)「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷(📉)之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然(📞)消声匿迹(🧓)了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名(🌶)远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真(🤹)相，对(🌊)再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」(🏕)展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之(🌁)AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以(🍧)及隐藏在游作过去的真相到底是———所有(🏦)的答案，都在「Link Vrains」中