故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在(⛏)那里有经(♉)由巨型(🍌)企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决(🌠)斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为(📩)的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而(🔴)他(😮)们的(🗑)目标是(🚐)将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站(💪)了出来。而他的名字正是「(😿)Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想(🛵)要得(🦏)手的迷(🤦)之AI程序。一度拯救了世界(😅)，然后却突然消声匿迹(🛫)了，而他(🎚)的名字就在互联网(⏰)的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命(🌸)运的(😠)齿轮就此转动……迷之(🚎)AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作(🅰)过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中