故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由(🖖)巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络(🆖)技术构筑而成的(💳)被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们(📴)都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「(🏟)LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行(🚄)为的谜之黑客集团「海诺因骑士团(🕐)」。而他们的(💖)目(🏖)标是将(🚱)存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场(😝)传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「(🍜)海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的(🌤)迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中(🗽)一瞬(🚫)间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木(📉)游作，为了寻找过去发生的某件(💫)事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此(🐎)转动……迷之AI的真身(🤘)，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过(🆗)去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中