故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空(🚓)间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」(🧣)中却出现了利(🚧)用决斗来进行(🏸)黑客行为的谜之(🍆)黑客集团「海诺因骑士团」。而他(🕵)们(🍩)的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世(🚗)界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他(🐅)的名字正是「Playmaker」。在那场传(🤡)奇的战斗中(🍩)，「(🦅)Playmaker」使用压倒性的决斗将「(🦁)海(📊)诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」(🚂)都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为(🔥)了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作(🗑)，为了寻(⬆)找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的(🏐)，以及隐藏在(🌡)游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中