故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里(❇)有经由巨型企业「SOL技术(🗒)社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间(♓)中(🥪)为体验到全(⬇)新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」(⚫)中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威(🥙)胁时(🔲)，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用(🏑)压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑(📰)士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却(🥪)突然消声匿迹了(🏔)，而他的名字就在互联网(🧒)的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「(🌀)Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作(♟)，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「(🥄)VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……(⌚)迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐(🍎)藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中