故事的舞台是互联网系(🐷)统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业(💈)「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被(🦄)称为「(👸)LINK VRAINS」的VR空间。人们都(🌲)在那个VR空(🏭)间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的(🛢)谜(👁)之黑客集团(🐗)「海(❤)诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的(🤽)“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的(🏽)决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷(😛)之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世(✂)界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某(🐨)件事(🌿)件的(🌊)真相，对再次在「VRAINS」出现的「海(🎷)诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷(🐃)之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的(🆔)真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中