故事的舞台是互联(⏮)网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经(🖌)由巨型企业「(🎑)SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」(🚅)的VR空间。人们都在那个(🐘)VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可(🔚)是在「LINK VRAINS」中却(🍈)出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名(🌊)决斗者站了出来。而他的名字正(🍖)是(♏)「Playmaker」。在那场传奇的战(😕)斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士(🐷)团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程(🈚)序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿(🤮)迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说(👋)。而现在，作为「Playmaker」的正(🤺)体的某位高中生藤木游(🏼)作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑(🥚)士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「(🥩)海诺因骑士团」盯(🛸)上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作(🕎)过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中